El Palacio del Cordón, del siglo XVI, y perteneciente en su origen a los condes de Puñonrostro, es sede, tras su remodelación según proyecto del estudio de arquitectos Mansilla Tuñón (finalista en 1997 del Premio de Arquitectura Contemporánea Mies van der Rohe), del Museo Provincial, que consta de una sección dedicada a la arqueología y otra a las bellas artes. En la primera destacan el ajuar campaniforme de Villabuena del Puente, los dos tesoros de Arrabalde -hallados en el Castro de las Labradas-, mosaicos y pinturas murales de Santa Cristina de la Polvorosa y las cruces votivas de oro de Villafáfila. En la segunda se pueden encontrar, entre otros, esculturas de los siglos XIV al XVIII.

La catedral alberga el Museo Catedralicio de Zamora, siendo el principal museo de la diócesis. En él destaca su colección de tapices de los siglos XV y XVI (serie "Guerras de Troya" y "campañas militares de Aníbal"), considerada una de las mejores del mundo.

Detalle del tapiz "La muerte de Paris", perteneciente a la extraordinaria colección de tapices franco-flamencos del museo diocesanoEl Museo Etnográfico de Castilla y León es un museo dependiente de la Junta de Castilla y León, formado parte de su Red de Museos Regionales. Está dedicado a mostrar la riqueza etnográfica, en un sentido amplio, de esta comunidad autónoma. Dispone de una exposición permanente dividida temáticamente y además se muestran exposiciones temporales con cierta regularidad.

El Museo de Semana Santa de Zamora fue creado en 1957 por la Junta Pro-Semana Santa con el fin de mostrar y proteger los grupos escultóricos de las procesiones. Se abrió al público el 9 de septiembre de 1964. Tras sucesivas reformas y ampliaciones el museo fue reinaugurado el 25 de febrero 1994. En la actualidad expone 36 grupos escultóricos, entre los que destacan los de los imagineros Ramón Álvarez y Mariano Benlliure, además de otros objetos relacionados con la Semana Santa de la ciudad.

La Exposición permanente de Baltasar Lobo recoge 50 a 70 obras de este artista en la Iglesia de San Esteban. Se está trabajando en la rehabilitación del Castillo de Zamora -con proyecto de Rafael Moneo - para albergar el futuro Museo Baltasar Lobo, con una importante cantidad de obras del escultor.